Forschungspraktikum - Quantifizierung von Proteinen für Lebensmittelsicherheit mittels automatisiertem splitGFP-Assay

Ihre Aufgaben

Das angebotene Praktikum unterstützt ein Projekt, das sich mit der Lebensmittelsicherheit auseinandersetzt. Dabei werden verschiedene maßgeschneiderte Proteine sekretorisch mit Corynebacterium glutamicum hergestellt. Die Proteine können eingesetzt werden, um Lebensmittelpathogene zu eliminieren, Mikroplastik in Getränken zu quantifizieren oder um den Einsatz von Pestiziden in der Agrarwirtschaft zu reduzieren. Durch die Anwendung automatisierter Workflows zur Kultivierung und Ernte der Bakterien können im Hochdurchsatz bis zu 48 Stammvarianten gleichzeitig hinsichtlich ihrer Sekretionseffizienz untersucht werden. Die Effizienz der Proteinsekretion kann mittels eines automatisierten splitGFP Assays bewertet werden. Die Auswertung erfolgt derzeit jedoch nur semi-quantitativ, da kein geeigneter Proteinstandard zur Verfügung steht. Im Rahmen des Projekts soll ein solcher Standard, ein Konjugat aus Horseradish Peroxidase (HRP) und einem GFP11-Tag, in Escherichia coli hergestellt und durch Affinitätschromatographie gereinigt werden. Nach der Quantifizierung kann dieser Standard zur Kalibrierung der Fluoreszenzwerte im splitGFP-Assay genutzt werden.

• Klonierung eines HRP-Produktionsstammes und mikrobielle Kultivierung im Labormaßstab

• Proteinaufreinigung der HRP mittels Affinitätschromatographie

• Qualitätskontrolle und Quantifizierung der HRP mittels SDS-PAGE und automatisierter Assays

• Validierung des Proteinstandards im splitGFP-Assay

• Selbstständige Auswertung und Präsentation der Ergebnisse der Experimente

• Sorgfältige Dokumentation der durchgeführten Arbeiten

  Es besteht die Möglichkeit, nach dem Praktikum eine Masterarbeit zur Vertiefung der Automatisierungskenntnisse anzuschließen.

Ihr Profil

• Sie studieren Biologie, Biotechnologie, Bioverfahrenstechnik oder eine verwandte Disziplin im Master

• Sie sind interessiert an Mikrokultivierung und Laborautomatisierung

• Sie sind bereit, sich in neue Methoden (z.B. Klonierung, Proteinaufreinigung, Kultivierung) und grundlegende Programmierung (Python) einzuarbeiten und/oder bringen bereits Vorkenntnisse in diesen Bereichen mit

• Sie besitzen ein hohes Maß an Selbstständigkeit, Motivation und Zuverlässigkeit

• Sie zeigen eine sehr zuverlässige, strukturierte und ordentliche Arbeitsweise

• Sie sprechen und schreiben verhandlungssicheres Deutsch oder Englisch (C1)

Wir bieten Ihnen

Wir arbeiten an hochaktuellen innovativen Themen und bieten Ihnen die Möglichkeit, den Wandel aktiv mitzugestalten! Wir bieten Ihnen:

• Ein interessantes und gesellschaftlich relevantes Thema für Ihre Abschlussarbeit mit zukunftsorientierter Themenstellung

• Ideale Rahmenbedingungen für Praxiserfahrungen neben dem Studium

• Interdisziplinäre Zusammenarbeit an Projekten in einem internationalen, engagierten und kollegialen Team

• Eine exzellente wissenschaftliche Ausstattung und die neueste Technologie

• Qualifizierte Betreuung durch wissenschaftliche Kolleg:innen

• Eigenverantwortliche Vorbereitung und Durchführung der übertragenen Aufgaben

• Einen großen Forschungscampus im Grünen, der beste Möglichkeiten zur Vernetzung mit Kolleginnen und Kollegen sowie zum sportlichen Ausgleich neben der Arbeit bietet

  Neben spannenden Aufgaben und einem kollegialen Miteinander bieten wir Ihnen noch viel mehr: https://go.fzj.de/Benefits

  Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, z.B. hinsichtlich Alter, Geschlecht, Behinderung, sexueller Orientierung / Identität sowie sozialer, ethnischer und religiöser Herkunft. Ein chancengerechtes, diverses und inklusives Arbeitsumfeld, in dem alle ihre Potentiale verwirklichen können, ist uns wichtig.